Sonic, Knuckles a Tails sú späť vo svojom doposiaľ najepickejšom dobrodružstve. Tím sa znovu spojí, aby čelil novému impozantnému nepriateľovi, Shadowovi, tajomnému ježkovi so schopnosťami, ktoré sa nepodobajú ničomu, čo kedy videli. Tím Sonic musí pristúpiť k nečakanému spojenectvu, aby spoločne zastavili Shadowa a zachránili planétu. Keanu Reeves sa pripája k hviezdnemu obsadeniu ako Ježko Shadow.