Cieľom Atlasu je podchytiť procesy, ktoré sa najvýznamnejším spôsobom podieľajú na novej sociálne priestorovej diferenciácii a významne ovplyvňujú kvalitu života obyvateľstva v mestách a obciach Českej republiky. Atlas je koncipovaný ako súbor 13 vzájomne previazaných kapitol, ktoré spoločne mapujú premeny sociálne priestorovej štruktúry v transformačnom období. Každá kapitola je vnútorne členená do niekoľkých mapových listov s krátkym analytickým textom podávajúcim základné informácie o sledovanom jave a mapami väčšinou v mierke 1:1 milióna. Atlas je spracovaný v českom a anglickom jazyku.